Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCLMP48507 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms