Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms