Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSG1P42857 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSG1P42857 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSG1P42857 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms