Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBX2P40425 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PBX2P40425 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PBX2P40425 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PBX2P40425 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PBX2P40425 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PBX2P40425 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PBX2P40425 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PBX2P40425 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PBX2P40425 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PBX2P40425 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PBX2P40425 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms