Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP1P29466 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP1P29466 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP1P29466 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP1P29466 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms