Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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