Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms