Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PTPRDP23468 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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