Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GCSHP23434 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GCSHP23434 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GCSHP23434 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GCSHP23434 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GCSHP23434 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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