Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XBP1P17861 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XBP1P17861 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms