Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms