Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms