Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNAP12004 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCNAP12004 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCNAP12004 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCNAP12004 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCNAP12004 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCNAP12004 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCNAP12004 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCNAP12004 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCNAP12004 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCNAP12004 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNAP12004 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNAP12004 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms