Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODC1P11926 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODC1P11926 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODC1P11926 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms