Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TMIGD3P0DMS9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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