Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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SFTPBP07988 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SFTPBP07988 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SFTPBP07988 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SFTPBP07988 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SFTPBP07988 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SFTPBP07988 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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