Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA4P06727 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms