Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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