Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLGNO14967 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms