Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.4 ms