Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms