Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms