Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA6L9A6NEM1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L9A6NEM1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms