Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms