Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms