Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms