Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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