Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NPC1L1Q9UHC9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms