Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms