Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms