Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms