Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms