Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms