Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms