Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUCLA2Q9P2R7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUCLA2Q9P2R7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms