Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms