Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VAPAQ9P0L0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VAPAQ9P0L0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VAPAQ9P0L0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VAPAQ9P0L0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VAPAQ9P0L0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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VAPAQ9P0L0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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