Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRNAU1APQ9NX07 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms