Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms