Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms