Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms