Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms