Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms