Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SEMA4CQ9C0C4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SEMA4CQ9C0C4 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SEMA4CQ9C0C4 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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