Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms