Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC13A1Q9BZW2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC13A1Q9BZW2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC13A1Q9BZW2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms