Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms