Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms