Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms