Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms